胃食管反流的微创手术指征如下： 1、经过严格内科保守治疗，通过吃质子泵抑制剂，症状没有明显缓解，这时候可以考虑做手术，手术主要指腹腔镜的胃底折叠术； 2、长期的胃食管反流可以导致食管狭窄，食管狭窄一般通过内镜，即胃镜下扩张、球囊支撑，往往可以改善，微创就可以治疗狭窄； 3、Barrett食管，正常的黏膜被鳞状上皮给替代，食管容易恶变，恶变率可以是正常人的10-20倍，所以现在可以通过在内镜下的黏膜切除治疗，这是目前最新、最流行的治疗方法。