月经期间不能做肠镜，因为做肠镜时病人取侧体位，将肠镜从肛门逐步放入到肠管内，逐步深入进行检查。如果来月经时此时月经血会引起外阴污染，使肠镜操作非常不方便，而且还有可能将血顺着镜体带入到肠管之内，从而影响检查。来月经时可能有不舒服的感觉，此时身体会出现扭动，此时可能影响做肠镜以及影响大夫进行操作。虽然做肠镜时会洗肠，洗肠不能做到特别干净，所以部分肠道存在残留物，如果经过阴道进入到生殖道，还会引起女性生殖道的感染。来月经和做肠镜会相互进行影响，所以月经期间不能做肠镜。