六神丸治疗急性咽炎与慢性咽炎均无确切疗效，未经过任何规范的临床研究证明，所以不建议使用。尽管说明书上标明可治疗咽喉炎，但实际上并无规范临床研究结果证实支持，并且说明书上标明不良反应尚不明确，说明药物对于自身的不良反应没有深入研究，所以用药不但无效，还存在较大风险。慢性咽炎需根据发病原因、病情轻重程度、持续时间长短采取有针对性的治疗措施，才可取得较好的疗效。慢性咽炎与胃酸、胃液的反流刺激相关，即是反流性咽喉炎导致。由于部分患者并无反酸感觉，故得不到及时、有效的治疗，从而会使反流性咽喉炎的咽部异物感、堵塞感、烧灼感等症状持续不愈，逐渐形成慢性鼻炎。此时可使用抑制胃酸的药物进行治疗，可取得较好的疗效。