慢性咽炎引起的舌根滤泡增生的治疗主要是采用药物治疗。引起慢性咽炎舌根滤泡增生的主要原因是咽喉反流，由于长期的咽喉反流刺激，引起舌根滤泡增生。治疗具体如下：1、抑酸药：如雷贝拉唑、奥美拉唑、泮托拉唑等质子泵抑制剂；2、胃肠动力药：如枸橼酸莫沙必利等；3、中成药：如丹参酮胶囊、肿痛安胶囊等；4、低温等离子治疗：如果患者慢性咽炎造成的舌根滤泡增生比较严重，引起睡眠呼吸暂停综合征，可以尝试用低温等离子治疗。其机理是在黏膜下烧灼滤泡，使其缩小，缓解上呼吸道梗阻情况；5、加强身体锻炼：部分患者由于急性炎症反复发作，如急性上呼吸道感染、急性咽炎，也会造成滤泡增生。这种情况就要加强身体锻炼，减少急性炎症的发生率。