早上睡醒以后眼睛疼痛的原因，第一个方面是眼睛的急性结膜炎，眼睛炎症后产生疼痛的感觉。第二种是眼睑的炎症即麦粒肿，还有一种是眼压增高、青光眼发作引起眼睛的疼痛。1、急性结膜炎：主要由于细菌对结膜的侵袭造成眼睛结膜感染，引起结膜的充血和水肿，反射性眼睛疼痛。一个晚上细菌在结膜囊繁殖或刺激，导致早上睡醒时眼睛炎症表现比较明显，分泌物较多，眼睛疼痛比较明显；2、麦粒肿：麦粒肿主要是眼皮上的Zeis腺或者睫毛毛囊Zeis腺的急性化脓性感染而形成脓包，脓包内部有张力，对眼睛皮肤刺激导致疼痛。早晨睡醒眼睛睁开后，对脓包进行刺激引起眼睛疼痛；3、眼压增高：眼压增高引起眼睛胀疼等不适，早晨眼压比较高，是眼压曲线的高峰。往往青光眼早上眼压升高比较明显，引起眼睛胀痛加重。