通常一代、二代和三代试管婴儿之间存在本质性区别，主要存在适应证不同。主要包括以下几方面内容：1、第一代试管婴儿：主要解决精卵无法相遇问题，大部分情况可能为输卵管梗阻、输卵管功能病变；2、第二代试管婴儿：主要解决精卵结合问题，即精子和卵子在输卵管内但无法自行结合。此种患者多见于男性重度少弱畸形精子症，因精子数量较少、质量不佳而无法自行完成受精过程。此时需要使用较细的针将精子放入针内，注射到女性卵母细胞中完成受精过程促使精卵结合；3、第三代试管婴儿：主要解决遗传方面的问题，如男性或女性染色体的问题，即本身染色体上遗传物质没有缺乏，但染色体某一个点和某一个点遗传物质出现交叉互换，可能到子代的染色体位置或者染色体数量会出现多一条、少一条情况，胚胎可能也会出现问题。如果男性或女性携带高致病风险基因，可以通过胚胎植入前进行基因筛查，即将高致病风险基因筛掉使胚胎不患疾病遗传性疾病。因此一代、二代、三代试管婴儿适应证不同，而并非级别越高越好。