多囊卵巢综合征的女性可通过查性激素六项了解基础内分泌，检查时间主要取决于检查目的。为观察基础状态，一般安排在月经来潮的第2-5天，早晨10点前空腹进行检查，如果是其他目的，需根据目的决定抽血的时间。基础状态的性激素六项检查是为观察是否存在高雄激素血症，泌乳素水平是否处于正常范围，黄体生成素和卵泡刺激素的比例是否已经失衡。除性激素六项检查外，同时还可以予以抗缪勒管激素检查，可以代表小卵泡的数目。多囊卵巢综合征的女性一般抗缪勒管激素比同龄人更高，也预示存在更多的小卵泡数目。如果多囊卵巢综合征女性查激素的目的不是观察基础状态，比如是观察孕激素水平，可以安排在排卵后1周抽血检查。