手足口疫苗常见的副作用，与其他疫苗注射之后引起的不良反应基本类似，比较多见的副作用包括以下几种：1、全身症状：最多见的是低热，在注射之后6-24个小时，可以出现发烧，体温很少超过38℃，多数会在37.5℃左右。可以伴有全身症状，出现轻度畏寒，轻度关节肌肉酸痛，可以有疲乏、无力的表现，通常不需要采用特殊的药物治疗，多数在2-3天，体温可以完全恢复到正常；2、局部症状：注射疫苗局部可以出现硬结、红肿、瘙痒，严重的患者可以出现局部渗出或者溃疡；3、消化道症状：可以表现为恶心、呕吐、腹痛、腹泻，持续时间较短，通常不需要特殊处理；4、呼吸道症状：患者可以出现咽痛、干咳，严重者可能会出现气闷、胸闷或者呼吸困难，很少出现严重缺氧表现以及呼吸困难；5、过敏反应：表现为过敏性荨麻疹或者血管神经性水肿，应用抗过敏药物后，过敏症状会逐渐消失。