细菌性阴道病和霉菌性阴道炎(外阴阴道假丝酵母菌病)的区别在于致病菌、临床症状、治疗方案不同，具体如下：1、致病菌：细菌性阴道病主要是由于阴道菌群紊乱，而厌氧菌是以加德纳杆菌为主的厌氧菌过度增殖，乳杆菌减少而引起的细菌过度繁殖，引起阴道的菌群紊乱。外阴阴道假丝酵母菌病主要是由在阴道内霉菌，如白色念珠菌、光滑念珠菌等，过度繁殖而引起的阴道炎症；2、临床症状：细菌性阴道病没有明显的炎症的表现，查体时阴道内有灰黄色的分泌物，且有异味，但没有明显的阴道充血。外阴阴道假丝酵母菌病主要的症状是外阴瘙痒、阴道豆渣样分泌物，且外阴阴道假丝酵母菌病容易反复发作，与月经周期有明显的相关性；3、治疗方案：细菌性阴道病要通过调整阴道的正常菌群，以及杀灭过多的厌氧菌而治疗，主要包括口服甲硝唑、替硝唑，以及阴道用甲硝唑栓剂，同时配合乳杆菌胶囊来恢复阴道的正常菌群。外阴阴道假丝酵母菌病要通过杀灭阴道内过多的真菌，包括应用抗真菌的药物，如克霉唑、咪康唑等，必要时口服抗真菌的药物，如氟康唑、斯皮仁诺(伊曲康唑注射液)等。总之，细菌性阴道病和外阴阴道假丝酵母菌病，是临床常见的两种阴道炎症，但致病菌、临床表现、治疗方案不相同。