生殖器流脓首先要判断流脓具体部位和脓液性质等情况，以及有无合并其它局部症状，甚至有无发热等全身症状。如果尿道口流脓，有脓性分泌物，要除外下尿路感染，可通过化验尿常规及分泌物细菌或病原体微生物培养帮助诊断，必要时还可做药物敏感试验验帮助选择针对性敏感抗生素。此外还需让患者大量饮水，达到多排尿，多冲刷尿道作用。如果外生殖器软组织局部脓性分泌物，要考虑皮肤性疾病，或较严重皮肤软组织感染，比如包皮龟头炎也会造成皮肤黏膜破损，造成流脓，需外用药物治疗。此外生殖器结核、生殖器肿瘤，比如阴茎癌也会造成生殖器流脓。如果出现生殖器流脓，需及时去专业医院就诊，避免出现病情延误。