屁股上有囊肿应该看结直肠肛门外科、肛肠外科或结直肠外科。若小医院没有这么详细的科室，可以看胃肠外科或普通外科。若患者出现屁股上囊肿可进行手术切除，切除后做病理检查，如果是单纯性囊肿，切除即可，无需担忧。若囊肿不是单纯性囊肿，可能提示为其他疾病，常见肛周脓肿，通常会导致屁股疼痛、皮肤发热，摸起来有硬块，此时应去结直肠肛门外科、肛肠外科或结直肠外科，及时进行手术治疗，以免延误病情。