检查脑部疾病选择CT还是核磁共振检查，需要依据疾病而定，常见如下：1、CT检查：患者检查脑出血、蛛网膜下腔出血等出血性病变、急性出血，进行CT检查较好；2、核磁共振检查：除以上疾病类型外，进行核磁共振较好，尤其病变位于脑干部位。CT检查时该位置骨头伪影较多，分辨率较低，易出现误差。核磁共振是三维立体结构，CT是平面结构，无论肿瘤、缺血性脑血管病，进行DWI或TWI能够发现数小时内急性期脑梗，磁敏感成像对于陈旧性出血，也可以较好观察。