胃黏膜损伤绝大多数可以自愈。其损伤包括各种因素，有机械性损伤，如异物刺激、扎伤，或者取活检造成的医源性损伤，多半都可自愈，有时会用黏膜保护剂、质子泵抑制剂、抑制胃酸的药物来帮助愈合。另外，像烫伤、直接食物刺激、HP感染引起的炎症性损伤，也可以自愈。HP感染引起的炎症性糜烂溃疡也属于胃黏膜损伤的表现，有一些可以治愈，存在自愈周期，有一些可能会持续存在，形成慢性的糜烂溃疡。此时需要用药物治疗，尤其对根除幽门螺杆菌进行治疗。因为反复存在幽门螺杆菌，即使溃疡治愈之后仍可能再次发作。因此，需根除幽门螺杆菌，同时应用抑制胃酸和保护胃黏膜的药，才能够根治溃疡。