注射HPV疫苗是否仍会感染尖锐湿疣，需根据疫苗种类，以及注射疫苗前是否已有感染进行判断。HPV疫苗包括2价、4价、以及9价疫苗。4价和9价疫苗包含HPV低危型，也就是包含导致尖锐湿疣的型别，但2价疫苗不包含，注射2价疫苗，虽然不保护尖锐湿疣，但防癌效果较好。4价和9价疫苗也可以防癌，同时也可以防性病，尖锐湿疣。此外，目前有的HPV疫苗是预防性的疫苗，不是治疗性，如果已经感染HPV，可以预防没有感染过的HPV型别，减少感染。但已经感染低危型病毒，疫苗并没有用。