肾结石疼痛有这几种原因：1、肾结石引起梗阻、肾积水、肾绞痛或是肾脏酸胀、疼痛，为肾脏压力高引起；2、肾脏摩擦引起肾脏黏膜损伤，由肾脏炎症引起；3、肾结石在肾盏里摩擦、出血，引起肾脏、肾盂炎症，都可以引起腰部的酸胀疼痛。肾结石有一种是含钙结石，一种是非含钙结石。含钙结石比较硬，容易对膀胱内黏膜、肾盂黏膜、输尿管黏膜造成损伤。损伤肾脏、肾盂里的黏膜，就容易出现血尿。血块有时也可以阻塞到输尿管，引起肾脏绞痛、肾脏憋胀、肾区叩疼、肾区酸胀不适、隐痛，这些都是肾结石引起疼痛的原因。治疗方法是解除梗阻，减少肾积水控制炎症，用一些消炎药，减少出血、减少运动。这对肾结石引起的疼痛有治疗作用。