男人肾结石一般不会影响精子质量。因为肾结石和精子不在一个系统内，具体如下：1、肾结石：结石常是肾脏产生，往往与一些遗传因素、代谢因素，包括水质、饮食有关，是在肾脏形成的结晶，慢慢变成结石。即便结石排出，也是从肾脏到输尿管、膀胱、尿道而排出体外；2、精子：是由睾丸产生，睾丸和肾脏是没有直接管道相通，所以结石、尿液，对于睾丸产生精子的功能没有影响。精子在睾丸产生以后，通过附睾进入到输精管，在性生活时与精囊液、前列腺液混合形成精液而排出体外。所以，肾结石和精液之间没有直接的联系。肾结石往往会引起剧烈的肾绞痛和血尿症状，小结石可以通过自主排石，或者借助一些药物来帮助排石。大结石可以通过体外冲击波碎石、禁闭肾镜、输尿管镜碎石等方式，促进结石的吸出或者排出，而精子是从睾丸产生，需要通过精液常规来评估精子质量和男性生育能力。