吹气查幽门螺杆菌总体而言较为准确，但如果在吹气前服用过抗生素，可能会抑制细菌的生长、活性，从而导致结果的假阴性，所以要求吹气前停用抗生素4周以上再进行检查，能得到较为准确的结果。另外，治疗胃病的药物，如质子泵抑制剂、H2受体拮抗剂、铋剂等均可能会影响幽门螺杆菌的活性，从而导致结果的假阴性，建议停药2周以上。除此之外，急性上消化道出血患者如果在出血急性期做呼气试验，由于血本身属于碱性成分，也可能会干扰结果，导致假阴性。如果避免这些干扰因素外，吹气查幽门螺杆菌是目前诊治幽门螺杆菌的一个重要依据，一旦发现是阳性，而且数值与临界值差值越大，越能体现体内存在幽门螺杆菌。