如果女性右侧叉腰部腹隐隐作痛，可以就诊科室如下：1、泌尿外科：可以进行相关检查，排查泌尿系统相关的问题，如泌尿系统B超排查肾积水、输尿管扩张、尿路梗阻的可能。如果存在上述情况，可能引起局部的胀感、疼痛等不适，可能表现为叉腰部位隐痛。此外还可以检查尿液，判断有无泌尿系感染。如果女性发生泌尿系感染，有时也有腰痛不适；2、骨科或者理疗科：部分病人的疼痛，与患者运动、体位、疲劳以后有关，需要考虑局部的肌肉或者韧带出现老化、损伤或者疾病。如果有劳损性病变，亦可出现相应症状。如果考虑上述方面的问题，通常建议病人就诊骨科或者理疗科，判断是否需要处理。