支原体很难转阴的常见原因如下：1、抗生素耐药：抗生素对支原体效果较差，支原体对抗生素产生耐药，效果较差；2、支原体反复感染：如夫妻双方没有同时治疗，相互传染是支原体复发的常见原因；3、抵抗力弱：抵抗力较弱后，容易出现药物治疗效果较差，而且转阴较慢，症状较重；4、局部卫生差：局部表面细菌没有完全清除，药物治疗后，外界细菌仍然存在，可以再进入生殖系统或者尿路，造成炎症的复发；5、支原体携带：没有症状，仅为支原体的携带者，1/3的患者不需要治疗，但不能完全转阴；6、化验误差：即出现假阳性现象。