龟头流黄脓、小便疼可以口服盐酸米诺环素配合热淋清颗粒、盐酸多西环素、阿奇霉素分散片配合八正胶囊、磷霉素氨丁三醇散、左氧氟沙星配合癃清片等药物。除此之外还可以肌注头孢曲松钠治疗。如下所示：1、盐酸米诺环素配合热淋清颗粒：盐酸米诺环素对淋菌性尿道炎、非淋菌性尿道炎引起的龟头、尿道口流脓和尿痛症状都有较好治疗效果；2、盐酸多西环素：对多种耐药支原体、衣原体有较好疗效；3、阿奇霉素分散片配合八正胶囊：阿奇霉素分散片配合中成药物八正胶囊治疗后，龟头流脓及尿痛症状会明显缓解；4、头孢曲松钠：可以肌注头孢曲松钠治疗，对淋球菌感染引起的尿道疼痛和尿道口流脓症状有较好的疗效；5、磷霉素氨丁三醇散：口服磷霉素氨丁三醇散对多种致病菌引起的尿道炎、尿道口分泌物及尿痛症状有较好的疗效；6、左氧氟沙星配合癃清片：龟头流黄脓、小便痛常常由混合细菌感染引起，需要规范药物治疗。如口服左氧氟沙星配合癃清片治疗后，龟头流黄脓和小便疼症状会明显好转。