宝宝反复发烧39℃，应及时前往医院就诊，化验血常规明确发热原因并采取相应措施，具体如下：1、若由于细菌感染引起，应积极选择敏感抗生素进行治疗，若由于病毒感染引起，则需要及时选择对症性的抗病毒药物治疗；2、应控制体温，若是6个月宝宝反复高热，则可以口服布洛芬或对乙酰氨基酚类退烧药，若是3-6个月宝宝，则选择对乙酰氨基酚类退烧药；3、若宝宝口服药物困难或伴频繁呕吐，无法进食的情况下，可以选择退热栓进行治疗，包括布洛芬栓、对乙酰氨基酚栓。若宝宝口服药物3天，临床症状仍未见明显缓解，则证明口服药物治疗效果并不理想。应及时复查血常规，观察血常规走向，是否存在治疗错误的情况。必要时需停用口服药物，改成静脉输液治疗。宝宝抵抗力较弱且免疫系统未发育完全，若此时炎症未能及时控制，可能将导致细菌、病毒进入血液系统，从而引起败血症或脓毒血症的可能。