宝宝膝盖疼的主要原因如下：1、生长性疼痛：如果宝宝表现夜间疼痛，而且是双侧膝盖交替或同时出现疼痛，在疼痛期喜欢让家长膝盖进行按摩，疼痛过后能够完全恢复正常，不影响正常的行走和活动。这种疼痛常为生长性疼痛，不必过度担心，只需观察宝宝疼痛出现的频率和频次即可。如果宝宝疼痛频率越来越高，建议控制宝宝的活动量，避免过度活动导致疼痛加重；2、炎症：如果宝宝疼痛伴有肿胀甚至发热，就要警惕存在感染。宝宝膝关节如果出现明显肿胀，而且疼痛剧烈，可能是发生了化脓性关节炎或者是骨髓炎。此时建议尽早到医院进行诊断，明确诊断之后给予及早处理；3、自身免疫性疾病：如果宝宝出现游走性关节痛，比如膝关节疼痛伴有肿胀，踝关节疼痛伴有肿胀，甚至出现其他关节疼痛伴有肿胀。这提示可能是自身免疫性疾病，建议到医院进一步排查自身免疫性疾病；4、外伤：如果宝宝在跑、跳之后，或者遭受外伤以后出现膝关节疼痛，考虑是外伤性因素。如果出现明显关节疼痛，甚至完全无法正常行走，建议到医院排查是否发生骨关节损伤，如果确实发生就要给予及时处理。