一旦患有肛周脓肿一定会疼，疼痛是肛周脓肿的最主要症状。除了自身感受到的疼痛以外，肛周脓肿局部会出现颜色发红、边界不清楚、肿胀，表面触诊会有波动感，有时如触摸水囊样感觉，按压脓肿的部位，会有强烈的疼痛。所以肛周脓肿的患者一定会疼，疼痛会限制患者本人的行动、坐卧，患者可能不敢用整个臀部坐在椅子上，可能用一半臀部坐椅子。部分肛周脓肿的患者，虽然表现为强烈疼痛，但是肛门局部并没有发现红肿病灶，此类患者通常脓肿部位比较深，处于盆腔深部，直肠指诊即可触诊到红肿部位，即肿胀的部位。在直肠内触点脓肿的部位，患者也会有强烈的疼痛感。严重的肛周脓肿患者除疼痛外，可能伴有发烧，甚至达39℃。发热是全身炎症反应，此时及时切开脓肿，将脓液引流，发热会自然缓解。