多发性肾结石的手术指征如下： 1、肾结石体积比较小，小于2cm，但是患者通过保守的排石治疗，如药物排石或者是体外碎石，没有达到碎石的效果，此时需要进行手术碎石； 2、肾结石体积比较大，大于2cm，因为石头过大，已经不适合患者药物保守排石或者是体外碎石，也需要通过手术方式碎石； 3、肾结石体积较小，但是已经引起梗阻，造成肾积水、感染、发烧、肾功能不良，此时也需要通过手术碎石解除梗阻。