更年期出现全身疼痛的主要原因如下：1、骨质疏松：患者更年期全身激素水平变化较大，尤其雌激素、孕激素在体内迅速减量，引发全身钙质流失，使骨关节、骨骼出现骨质疏松，产生全身疼痛症状。此时患者需要有效补钙或进行更年期激素替代治疗，可以缓解骨质疏松；2、神经系统敏感性增高：更年期女性体内激素水平波动，使全身神经系统敏感性增高，可以引发全身疼痛症状。此时建议患者放松心情、调整生活作息制度、补充维生素，可以缓解疼痛症状。