治疗疾病时奥美拉唑可能需要应用2个月左右，通常无需再次延长服药的时间。奥美拉唑是质子泵抑制剂，在应用时可抑制胃酸，并且应在餐前服用。根据不同的病因在应用奥美拉唑进行治疗时，疗程也存在差异。比如患有胃食管反流时，若食管下段未出现糜烂可按需服药，出现烧心、反酸时即可服用，症状缓解时即可暂停。对于患有胃溃疡或十二指肠溃疡的病人，奥美拉唑通常需服用6-8周。在根治幽门螺杆菌时也会应用奥美拉唑，疗程是10-14天。病人应遵医嘱服药，避免服药后在症状缓解时自行服药。长期服用奥美拉唑会出现不良反应，可能会出现骨质疏松，甚至诱发胃癌、食管癌以及结肠癌，还可以导致萎缩性胃炎以及胃息肉的发生。