鼻腔根部疼、喉咙上面疼通常指鼻子后端和咽喉交界处，即鼻咽部疼痛，一般属于鼻咽炎的表现，通常这个情况应该不会很严重，但是有时疼痛的时间比较长。如果时间比较短，并且还有明显鼻塞、头痛等症状，通常还是与感冒有关。1、上呼吸道感染：感冒本身就是急性上呼吸道感染，包括急性鼻炎、急性鼻咽炎以及急性咽喉炎，所以鼻咽部就可以出现一些疼痛、不舒服的症状。这个情况一般症状不会很严重，即使有点发热，通常也会在3天之内逐渐退热。所以这个情况要注意，不需要过多的药物治疗，只要好好休息，一般感冒这些上呼吸道感染的症状会在1周左右逐渐缓解和自愈；2、胃酸、胃液反流：如果这个疼痛不严重，但是持续时间较久，有的患者会持续几周，甚至几个月、几年不好，就要考虑和胃酸、胃液反流的刺激因素有关。因为很多反流性咽喉炎患者经常没有反酸的自我感觉，所以这个因素经常被忽视，也就导致了得不到及时正确的治疗。因此遇到这个情况，要用抑制胃酸的药治疗，才能取得好的疗效。