肾囊肿三厘米一般不严重。肾囊肿对肾脏的影响主要表现在其可以牵拉肾脏包膜，导致病人出现肾区不适。另外，如果囊肿长得比较大，可以挤压肾脏实质，甚至会导致病人出现肾功能不全等表现。肾囊肿大于四厘米时，可以对肾脏实质造成比较严重的挤压。如果肾囊肿是三厘米，对肾脏影响比较小，一般对肾包膜的牵拉也较小。所以，肾囊肿三厘米通常对肾脏影响较小，不严重，可以进行临床观察，一般要求病人每三个月到半年复查一次肾脏超声。肾脏超声可以观察囊肿大小，如果囊肿生长速度比较快，要密切观察囊肿长大的情况。如果囊肿缓慢生长，可以不管。另外，需观察囊肿的囊液是否清亮，内部有无分隔、新生组织、钙化等。如果有上述情况，要考虑囊性肾癌的可能，需要积极治疗。