大便的时候肛门疼，最常见的是肛裂的情况。肛裂是指肛门周围皮肤和黏膜有裂口，大便时疼的厉害。治疗肛裂首先要尽量保持大便湿润、润滑，不用太费劲，另外，尽量减少对肛门括约肌的刺激。肛门局部要进行清洁、消炎对症处理，防止炎症加重对括约肌的干扰和刺激，可以用药物，如镇痛药栓塞到肛门或抹具有轻度麻醉作用的药膏到裂口上，还可以使用肉毒杆菌毒素，也可以注射到肛门外括约肌，使肛门括约肌暂时性麻痹，也可以缓解疼痛。此外，还有用扩肛疗法以及手术疗法。扩肛疗法是在麻醉的作用下，使肛门括约肌解除痉挛，在肛门解大便的时候就不会疼痛。手术是切除相应肛裂，需要到医院就诊，得到相应的正确治疗。