指关节疼痛的原因有多种，以下是一些常见的原因：

1. 腱鞘炎：这是较为常见的原因，主要由于手指过度活动，导致手指屈肌腱在腱鞘内反复摩擦引起水肿，在牵拉过程中，出现无菌性炎症，进而导致疼痛。有时还会出现卡压或者梗阻。
2. 滑膜炎：滑膜炎即关节的滑膜炎症，由于关节周围存在滑膜，可以保护关节、分泌滑液。随着年龄增大，关节逐渐出现滑膜退变，属于病理性变化，称为滑膜炎。部分滑膜炎是滑膜水肿、增厚，还有一些特异性的滑膜炎，可能与类风湿疾病、结核以及其他免疫性疾病相关。
3. 其他疾病：指关节疼痛可能与全身性疾病有关，例如痛风石可能引起手指关节痛风性滑膜炎，导致关节疼痛。还有全身性代谢性疾病，例如糖尿病导致四肢微循环障碍，关节循环不良引起疼痛。另外在特殊情况下，肿瘤、神经损伤也可能导致手指关节疼痛。

对于指关节疼痛的治疗，首先需要确定病因，以便有针对性地进行治疗。如果疼痛是由腱鞘炎或滑膜炎等常见原因引起的，可以通过休息、冷敷、应用药物和物理疗法等方法进行治疗。如果疼痛持续或加重，建议及时就医，以便得到专业的诊断和治疗。