人附睾蛋白4和CA125都是用于诊断卵巢癌的标志物，但它们的准确度存在一定的差异。
人附睾蛋白4在诊断卵巢癌方面比CA125更准确。具体来说，人附睾蛋白4的检测不受女性绝经期状态的影响，可以在月经周期的任何阶段进行，并且不受激素治疗的影响。然而，人附睾蛋白4并非100%准确，在部分已确诊卵巢癌（常见于粘蛋白型卵巢癌或生殖细胞型卵巢癌）的患者中，人附睾蛋白4可能并无水平异常；人附睾蛋白4在子宫内膜癌中也有较高阳性率。
另一方面，CA125是胚胎发育期间体腔上皮中的一种高分子糖蛋白，诊断卵巢癌的敏感性为80%。卵巢癌Ⅰ期CA125阳性率很低，仅为30%～50%。此外，CA125存在一些缺点，如组织特异性差，绝经期女性指标影响大。
因此，尽管人附睾蛋白4在卵巢癌筛查和诊断中的应用仍然非常有限，但它在某些情况下比CA125更准确。目前没有一种单一筛查的模式可以作为一种理想的筛查方法，因此CA125与人附睾蛋白4的联合检测仍然是目前简单高效的卵巢癌早期筛查手段之一。
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