卵巢囊肿5.5cm×4.0cm是否严重，需要根据囊肿的性质和患者的具体状况来判断。
1. 如果卵巢囊肿为良性，没有出现明显的不适症状，那么一般情况下并不严重。建议患者定期进行B超检查，密切关注囊肿的变化，如果囊肿变大或出现不适症状，及时进行相应治疗。
2. 如果卵巢囊肿是生理性的（例如黄体囊肿），那么通常不严重，可以自行缩小或消失。如果伴有痛经等症状，或者囊肿增大，需要及时进行手术处理，以免囊肿破裂。
3. 如果卵巢囊肿是病理性的（例如卵巢子宫内膜异位囊肿或卵巢炎性囊肿），可能会出现不孕、严重痛经、发热等症状，这时较为严重。对于病理性的卵巢囊肿，如果增大或者怀疑有恶变可能，应尽早进行手术治疗，并根据术中情况和术后病理检查进行相应的辅助治疗。
以上内容仅供参考，严重程度判断需要结合个体自身状况综合判断，建议咨询专业医生获取更准确的信息。
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