胆总管囊肿属于先天性疾病，如果不及时治疗，有可能会出现胆管癌严重的并发症。胆总管囊肿现在采用的手术方式主要是胆总管囊肿的完整切除以及胆管空肠重新吻合。这种手术方式保证了能够尽量的把胆总管有病变的成分完整的切除，同时胆管空肠重新建立吻合，以保证肝脏合成的胆汁能够重新进入到肠道，成功的手术可以把胆总管囊肿彻底的治愈。对于囊肿比较大，囊肿已经深入到胰腺，累及了肝脏，有可能会做连同肝部分切除，这种手术还存在着一定的风险。为了避免手术当中出现额外的副损伤，特别是对胰腺的损伤，会保留一部分的胆管，其中也有可能会保留一部分囊肿壁，手术后需要定期的观察，定期的CT等影像学检查，以发现残留的一部分囊肿是否依然有发生癌变的风险。