一般凹陷较轻的患者，尤其＜1cm的颅骨凹陷性骨折，对下方的脑组织压迫较轻微，通常不会遗留很严重的后遗症。但针对凹陷程度比较深的骨折，可能会引发患者出现后遗症，如可能会引发患者癫痫，但这种外伤性的癫痫可以通过药物进行控制。如果通过规律服用抗癫痫的药物进行治疗，患者的疗效不是很满意，也可以通过手术的方式解决。颅骨凹陷性骨折引发患者癫痫进行手术之前需要定位，判断是否为凹陷性骨折导致的异常放电而引发的癫痫，一旦确认则需要进行癫痫灶的切除，可取得较好的效果。另外，部分患者的语言功能可能会受到影响，引起语言障碍，还会导致肢体的运动无力，可以通过术后规范性的康复训练得以恢复，可得到较好的预后。