结膜和角膜组织互相移行，如果结膜有炎症可能会蔓延到角膜组织，因此结膜有炎症时，不可以接受激光矫正手术。结膜炎在发炎时，会表现有眼痒、少量分泌物、充血、水肿，眼干、眼涩、视物下降、视力下降等。这时需要鉴别慢性结膜炎的病因，是病毒引起还是细菌引起，或者是过敏所导致，甚至严重的干眼症。在干眼症时由于角膜表面内膜不稳定，视力表现也不稳定，此时也不适合进行飞秒激光手术。应给予补充人工泪液，以及角膜保护剂，等结膜炎炎症消失，眼睛属于完全正常状态后，可以进行角膜激光手术。