克罗恩病的肛瘘是克罗恩病的并发症，主要有以下几种特点：1、带有其他系统疾病：克罗恩病是全身系统的疾病，伴有肛瘘的同时，肠道、食管、胃等其他系统也有病变，伴发全身的其他系统疾病较多；2、比较复杂：外瘘较少、内瘘较多，治疗比较麻烦、发病比较缓慢；3、引起直肠狭窄：可能会引起周围肛门和直肠狭窄，因为瘘管反复生长且内瘘较多；4、不易愈合：普通肛瘘可能经过挂线治疗、切开、切除治疗能够愈合，克罗恩病肛瘘一般不能治愈，治疗的主要目的是缓解症状。如克罗恩病肛瘘伴发周围感染，引起肛门周围疼痛，可以切开引流，将感染物引流出来，但目的并不是治愈肛瘘。