小肠造影可检查小肠运动功能是否异常，怀疑肠易激综合征患者会进行小肠造影，如果显影剂排空过快，考虑存在肠易激表现。克罗恩病或其它的炎症胃肠病如溃疡性结肠炎等，有时也会进行小肠造影。临床医生根据检查目的不同选用不同的检查方法，常规做胃镜可排除胃十二指肠等上消化道出血疾病，结肠镜可排除结直肠下消化道出血。排除后若患者仍有不明原因的消化道出血，怀疑小肠出血时也会做小肠造影。