肿瘤标志物正常并不能排除肝癌的诊断。肝癌可以分为原发性肝癌和转移性肝癌，不同来源的肿瘤细胞肿瘤标志物也存在较大的差别，如：1、原发性肝癌：主要是甲胎蛋白异常升高，2/3的原发性肝癌患者甲胎蛋白显著升高，另外1/3反而正常；2、转移性肝癌：包括胆管癌、结直肠癌、胃癌、胰腺癌等发生肝转移，相对应的肿瘤标志物也存在着较大的区别。胆管癌、胰腺癌主要表现为CA19-9异常升高，而结直肠癌主要表现为癌胚抗原即CEA异常升高。所以对于肿瘤标志物的筛查，通常是多种同时检测。部分早期肝癌，无论是原发性肝癌、转移性肝癌，均可出现肿瘤标志物正常，但是影像学可以确诊。所以肿瘤标志物正常不能够排除肝癌的诊断，需要结合多种影像学检查进行判断，包括CT、核磁共振等，必要时可以做全身PET-CT扫描。在肿瘤来源不清楚或者是无法排除恶性肿瘤时，还需要进行穿刺活检，进行病理诊断。