超声内镜是从属于消化科内镜的一种检查，与电子胃镜的检查方法有较高相似性。通常进行超声内镜检查之前，需要患者口服局部麻药，精准进镜到达需要观察的部位。​通常消化道的管壁，例如胃腔、肠腔都可以分为四层，包括黏膜层、黏膜下层、固有肌层和浆膜层。如果病变并不位于最浅层的黏膜层，生长在下层时，进行胃镜只能判断在黏膜下层存在肿物，但是无法判断肿物生长部位，生长部位对病变的下一步判断、病变性质以及治疗方法都较为重要。电子超声内镜就可以判断病变位置，到达病变部位以后，局部插入一个小的超声探头，然后在胃腔内注水以后，观察病变发生的部位。不同层次的肿物，病变性质通常不同，所以根据超声内镜的结果，可以判断疾病类型、组织来源以及治疗方法。如果病变较浅，可以在胃腔内将病变完整切除，如果病变较为靠外，可能需要外科手术解决病变。