新生儿腹泻原因通常有以下几种情况：1、消化不良：最常见原因是消化不良，新生儿消化系统发育未完善，母乳喂养的妈妈需要调整清淡饮食。如果乳汁内脂肪含量高，新生儿通常出现脂肪类消化不良，出现脂肪腺；2、感染性腹泻：新生儿大便次数比之前明显增加、变稀，需要化验大便，排除细菌感染性腹泻，如果患细菌感染性腹泻，需要头孢类抗生素抗感染治疗，效果更好；3、乳糖不耐受：新生儿吃奶就腹泻，通常提示乳糖不耐受，针对乳糖不耐受、母乳喂养的新生儿，可以在给他吃母乳前使用乳糖酶，帮助消化母乳里的乳糖。针对乳糖不耐受的新生儿吃奶粉，可以把奶粉换成不含乳糖的腹泻奶粉；4、牛奶蛋白过敏：新生儿腹泻同时伴较严重湿疹，或其他容易过敏的症状，考虑牛奶蛋白过敏，此时需要把奶粉换成深度水解蛋白奶粉，或者氨基酸配方奶粉。