泮托拉唑钠肠溶胶囊主要具有抑制胃酸的功效，其副作用主要是表现在以下几方面：1、胃肠道不适：有些患者在使用泮托拉唑之后，可能会出现胃肠道的不适，会表现为口干、上腹部疼痛、便秘或者腹泻的情况，但一般来说症状还是比较轻，大多数也是一过性的发作；2、神经系统副作用：泮托拉唑钠对于个别患者，也可能会出现神经系统的副作用，包括头晕、头痛等相关不适症状，个别患者还可能会出现失眠的情况；3、全身不适：有些患者在使用泮托拉唑之后，可能会感觉到全身乏力、无力等相关不适症状；4、影响肝脏：泮托拉唑对于有些患者也可能会出现肝脏的影响，会表现为转氨酶的升高，但是泮托拉唑总体来说，安全性还是比较高，一般副作用比较小；5、影响维生素B12的吸收：需要注意的是，对于长期使用泮托拉唑或者是其他抑酸药物的患者来说，应该注意维生素B12的水平。因为有些患者，特别是对于长期使用泮托拉唑的患者来说，可能会影响维生素B12的吸收。总之，泮托拉唑钠肠溶胶囊是一种比较安全的药物，如果患者在用药的过程中出现了副作用，建议最好能够及时咨询医生或者是药师。