小便发黄而且有腥臭味，具体的用药要根据病因进行选择，具体分为4类原因：1、膀胱炎：主要的治疗是应用抗生素进行处理，对于男性主要推荐应用左氧氟沙星，可以根据尿培养的结果选择敏感的抗生素进行处理；2、尿潴留：尤其是慢性尿潴留，就应当对尿潴留发生的原因进行追查，尿潴留发生的原因是以下尿路梗阻为多见，尤其是前列腺增生，在治疗上可以应用α受体阻滞剂扩张尿道，解除局部的动力性梗阻，让尿液排出更加顺畅，减轻尿潴留的症状，必要时还可以行手术治疗。尿道狭窄引起的尿潴留主要以手术治疗为主，神经源性膀胱引起的慢性尿潴留，常是以清洁自家导尿，甚至长期留置尿管进行处理；3、生理原因：饮水量过少、尿液浓缩加之在膀胱的存储时间过长，膀胱对尿液有一定重吸收功能使浓缩加重；摄入大量蛋白，蛋白的分解终末产物是尿素，也会使尿液的臭味加重。一般不需要做药物上的治疗，主要是多饮水，改善膳食结构，就能够达到缓解症状的目的。