激光矫正近视是目前十分安全高效的治疗手段，但作为手术也同样存在发生几率较低的危害，表现为术后患者可能发生干眼或使原有干眼症状加重。因为激光可能伤及角膜的神经末梢，从而导致干眼症状加重。另外，激光矫正手术后患者还有可能发生过矫、欠矫或术后视力回退的情况。此外，部分术式需要制作角膜瓣，因而可能导致患者术后发生角膜瓣的复位不良、角膜瓣下混浊以及角膜感染等危害。还有部分患者在激光矫正近视眼手术后会发生眩光，视觉质量无法得到较好的提升。尽管上述危害的发生几率极低，但也仍然存在。