肚脐上下隐隐作痛，可能有以下几个方面的因素，如小肠病变。肚脐上下部分全部都是小肠，小肠有病变的时候，此处就可能出现隐隐作痛。小肠有两个大类的疾病，一类是功能性的疾病，一类是器质性的疾病，具体如下：1、器质性疾病：即小肠炎性病变，比如克罗恩病、肠结核，还有非特异性炎症，这些一般可能会有隐隐作痛。除了炎症性疾病，还有肿瘤性的疾病，比如淋巴瘤、间质瘤、腺癌等，此类器质性疾病也会引起腹部隐隐作痛。一般需要通过消化道造影或者腹部CT检查，进行排除或者明确诊断；2、功能性疾病：功能性疾病一般是由于自主神经功能紊乱所引起，肠功能紊乱所造成。当肠功能紊乱时，小肠收缩节律会异常，快速收缩导致痉挛性腹痛，有时候又不收缩，可能会引起腹胀。此时给予调节胃肠道功能的药物，补充益生菌，一般都会有不错的治疗效果。除了小肠病变之外，肚脐上下的其他器官病变相对比较少，可能有横结肠病变。横结肠病变一般常见的是炎性病变或肿瘤性病变。此类情况一般需要通过结肠镜的检查，进行明确的诊断或者排除。