在获取标本时会刺激咽部，而导致咽部的不适、咳嗽、恶心、呕吐等不良反应，但此类不良反应在检查结束后，会很快自行缓解，所以做核酸检测有不良反应存在，但不良反应也会自行缓解，一般不痛苦。核酸检测时，通常要获取呼吸道标本，而呼吸道标本的获取，经常通过咽拭子完成。做咽拭子时，会用带有长柄的棉棒，在头端会在咽腭弓和扁桃体，获取上呼吸道的标本进行核酸检测。而对于做新型冠状病毒核酸检测，虽然有不良反应，但还不能够达到痛苦的程度，所以做新型冠状病毒核酸检测不痛苦，但是会有一定不适存在，此类不适可以被接受，而且可以自行缓解。