肛门痛需要根据不同原因进行相应处理。若肛门痛由肛窦炎或肛裂引起，可以擦止痛膏，如利多卡因乳膏、复方甘菊利多卡因乳膏，以及痔疮膏，如马应龙痔疮膏、复方角菜酸酯软膏即太宁软膏、冷敷凝胶、以及复方多粘菌素B软膏等，均可针对性进行治疗。若肛门痛由肛周脓肿所引起，肛门周围有炎症包块甚至脓肿。此时无论是痔疮膏或止痛膏的效果均不佳，需要手术加以抗感染药物，如抗生素才能缓解。所以肛门痛通常需要到结直肠肛门外科或肛肠外科检查，明确肛门痛的具体原因，根据不同原因应用相应药物，甚至手术治疗。