低分子肝素钙的注射方法主要为皮下注射，可减缓吸收的速度，使血药浓度能够维持较长的时间。若进行肌肉注射，因为肌肉里的血管比较丰富，注射后的药物吸收速度过快，可能达不到持续的较高的血药浓度。少数情况下，可进行静脉注射，静脉注射低分子肝素钙的几率不高，通常很少。在注射低分子肝素钙时，注射部位通常为上臂或腹部的肚皮上。注射时应避免扎得过深，在皮下即可。注射进去以后，将注射器的活塞往抽，看是否注射到血管中。如果将药物注射至血管中，会导致血药浓度迅速提高，少数情况下，可能会导致出血风险或药物吸收过快。