排便结束后肛门出现疼痛，常见原因如下：1、肛裂：典型肛裂的疼痛呈周期性变化，排便时肛门疼痛，排便结束后疼痛缓解1-2分钟，之后会再次出现更加强烈的疼痛。疼痛持续时间可长可短，有的患者可以持续几分钟，有的患者可能持续一整天；2、盆底痛：较多引起肛门或者会阴区疼痛的病因目前尚不明确，因此称盆底痛。常见的盆底痛为盆底肌痉挛综合征，即排便结束后肛门会出现痉挛，出现间歇性、阵发性疼痛，疼痛可长可短，可能持续几分钟，甚至几个小时。引起盆底肌痉挛综合征的原因目前尚不明确，目前并没有明显、有效的方法进行治疗，可能只是予以对症治疗，即镇痛治疗即可。