心房肥大的治疗关键是要找到导致心房肥大的原因，积极治疗原发疾病。最早发现心房肥大有可能是心电图的描述，也有可能是超声心动图的描述。有时心电图描述为心房肥大，并不一定真的是心房内径的扩大，需要心脏超声进一步来证实。如果超声心动图证实了心房确实肥大，还需要进一步明确心房肥大的原因，确定是先天性心房肥大，还是慢性心肌缺血、瓣膜病变导致的心房肥大。常见的心房肥大原因有扩张性的心肌病、缺血性心肌病、肺源性心脏病、高血压性心脏病、病毒性心肌炎后遗症等，这都需要积极治疗原发病。如果心房肥大又合并房扑和房颤，还需要额外抗凝治疗和稳定心率的药物治疗。