引起扁桃体发炎并发口腔溃疡在临床上比较常见，病因还是比较多的，病因包括以下几种：1、病毒性感染：手足口病、单疱病毒感染，在发作的时候，可以表现口腔、口颊黏膜有很多斑丘疹。如果破溃以后，可以再形成一个小溃疡。而且这种病毒感染的同时，可以侵犯到扁桃体的被膜以及实质，从而引起相关的疾病；2、疱疹性咽峡炎：咽峡是口咽部的一个重要的解剖结构，疱疹性咽峡炎顾名思义，就是疱疹就长在咽峡部位。而扁桃体是咽峡的组成之一，而且在咽峡部黏膜的疱疹，也会在口腔的连接处形成一些溃疡及斑丘疹样的改变；3、化脓性的感染：化脓性的扁桃体炎，在抵抗力差的时候，同时也可以伴发口腔溃疡的形成。在这个时候如果查血常规，常常可以看到中性粒细胞、白细胞甚至C-反应蛋白都是增高的；4、需要注意的是扁桃体的炎症、口腔溃疡也可以以癌症这种病情存在，在早期可能从外观上看难以将其与炎症性溃疡相鉴别，临床确诊主要依靠活检，而且对于一些免疫功能比较差的病人，比如癌症放化疗以后的病人也容易引发口腔的多发溃疡，而且扁桃体反复发炎；5、B族维生素缺乏的病人，黏膜功能一般不会好，经常反复发作口腔溃疡也会发作扁桃体炎。所以，如果扁桃体炎并发了口腔溃疡，建议到正规医院耳鼻喉科或者是口腔科去看一看。